Les reptiles ont plusieurs points en commun avec les mammifères. Ils ont un oesophage, un estomac, des intestins, une trachée, des poumons, des reins, un foie, un pancréas, etc. Cependant, il existe plusieurs points qui différencient les reptiles des mammifères. Par exemple, ils ont un coeur qui ne comporte que trois cavités au lieu de quatre. L'anatomie des reptiles se ressemble d'une espèce à l'autre, mais il existe tout de même des différences du point de vue anatomique entre les tortues, les crocodiliens, les lézards et les serpents.